Bifidobakteriya oddiy buzilish va past - harorat bakteriyalarini samarali ravishda inhibe qilishi mumkin. Uning antibakterial effekti asosan ovqatlanish va yopishtirishlar va antibakterial moddalar ishlab chiqarish va tananing daxlsizligini kuchaytirish musobaqasi. U ichak patogen bakteriyalarini yopishtirish va takrorlashga ta'sir qiladi. Qarama-qarshilikka va kasallik patogenezini to'sib qo'yish. Bifidobakteriya tomonidan ishlab chiqarilgan antibakterial moddalar asosan organik kislotalar, bakteriocins, bakteriocins va boshqa antibakterial moddalardir.
Bifidobakteriyalarning metabolitlari, masalan, vodorod ionlarining metabolitlari bo'lgan yog 'kislotalari, masalan, vodorod ionlarining patogen bakteriya hujayralarida joylashgan. Vodorod ionlari sitoplamni kislotatsiya qilish uchun patogen bakteriyalar hujayralariga kirib boradi va antibakterial effektlarga erishish uchun patogen bakteriyalarni ta'sir qiladi.
Tadqiqotlar shuni ko'rsatadiki, bifidobakteriyalar brotansi vitroga antibakterial ta'sir ko'rsatadi va past pH uning antibakterial ta'siri uchun muhim shartdir. Bundan tashqari, ba'zi biidobakteriyalar ribotor tomonidan sinthazamiy effektlar bilan sinthine ishlab chiqaradigan proteinni ishlab chiqarishi mumkin, bu boshqa patogen bakteriyalarning o'sishini inhibe qilishi mumkin bo'lgan bakterial toksinlar deb ataladi.